中國科學院水生生物研究所研究人員在萊茵衣藻中建立了一套利用人工miRNA敲除基因的技術平臺。該技術利用衣藻內源miRNA前體做為骨架，針對葉綠體相關基因VIPP1和鞭毛基因CDPK3分別構建人工miRNA，采用8條引物退火合成人工miRNA前體的一步構建法和熒光素酶基因融合表達的方法，實現快速構建和篩選的目的。具有操作簡單、成本低、篩選高效等優點。主要實驗結果如下：（1）通過一步法退火合成人工miRNA前體結構，并將熒光素酶基因和一步法合成的人工miRNA前體結構融合于PsaD啟動子下游共表達。通過檢測熒光素酶活性或利用Photo counting 相機直接成像，快速篩選靶基因敲降克隆。靶蛋白VIPP1可下降至野生型的22-74%。（2）人工miRNA干擾效果會隨時間減弱，篩選到的陽性克隆在*月的干擾效果*好。（3）通過在熒光素酶基因和人工miRNA前體之間融合入內源基因RBCS2的內含子1或內含子3，明顯增強了熒光素酶活性和人工miRNA的干擾效果。較未加內含子的陽性克隆，熒光素酶活性分別增強至333%或401%，而靶蛋白VIPP1含量也比野生型下降至5%或3%。將內含子3融合入靶基因為CDPK3的人工miRNA載體中，也可使靶蛋白CDPK3下降至野生型的5%。（4）誘導型NIT1啟動子在人工miRNA表達載體中同樣適用，通過更換培養基中氮源為氨基鹽或硝酸鹽，從而抑制或誘導干擾載體的表達。