小分子物質(zhì)結(jié)構(gòu)與熔點及蛋白親和性定量構(gòu)效關(guān)系研究
面對海量的數(shù)據(jù)以及科學(xué)家們對化學(xué)知識規(guī)律的不斷需求,產(chǎn)生了化學(xué)信息學(xué)這一門新的學(xué)科。針對化合物熔點性質(zhì)和生物活性,本文從下面幾個方面展開化學(xué)信息學(xué)中的QSPR/QSAR研究工作: *章對現(xiàn)今可利用的數(shù)據(jù)庫基本情況進(jìn)行基本說明。
第 二章則對兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較討論,試圖說明在QSAR/QSPR研究中經(jīng)常碰到的一個基本問題。結(jié)果表明LLR(局部模型)對于結(jié)構(gòu)散布度很大的分子結(jié)構(gòu)多樣化的大樣本數(shù)據(jù)沒有效果;但是對于散布度較小且均勻的數(shù)據(jù)集,LLR局部模型能充分表達(dá)近鄰分子所包含的特殊結(jié)構(gòu)特征與分子性質(zhì)之間的關(guān)系,顯示良好模型結(jié)果。
第三章采用3D-QSAR/QSPR方法(比較分子場)對黃酮類化合物結(jié)構(gòu)與熔點性質(zhì)和蛋白質(zhì)親和性之間的關(guān)系進(jìn)行了討論。文中同時采用新近提出的電性距離矢量、三維全息原子場作用矢量以及分子比較場方法針對41個黃酮類物質(zhì)的GABA_A蛋白受體親和能力,建立了2D、3D-QSAR模型,模型結(jié)果表明,新發(fā)展的描述子能良好地表征分子的結(jié)構(gòu)信息,建立穩(wěn)定的QSAR模型。同時表明2D模型好于3D模型。
第四章采用兩種結(jié)構(gòu)相似性聚類篩選分析方法對結(jié)構(gòu)多樣性豐富的似藥小分子數(shù)據(jù)庫中的化合物進(jìn)行篩選然后進(jìn)行QSPR建模,對于篩選出的某一類化合物數(shù)據(jù)集,其模型結(jié)果優(yōu)于文獻(xiàn)采用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)方法建模。
第五章則針對物質(zhì)相似性問題,提出了一種基于性質(zhì)的同系物結(jié)構(gòu)相似性度量的概念和方法。文中指出,對于不同的性質(zhì)的同系物,其分子結(jié)構(gòu)的相似度是不同的。
【關(guān)鍵詞】:定量構(gòu)效關(guān)系 局部模型 全局模型 分子比較場 分子結(jié)構(gòu)相似性